1. Các Phòng chuyên môn thuộc Sở Nông nghiệp và Môi trường:
a) Văn phòng Sở;
b) Thanh tra Sở;
c) Phòng Kế hoạch, Tài chính;
d) Phòng Quản lý đất đai;
đ) Phòng Môi trường;
e) Phòng Tài nguyên nước, Khoáng sản và Biển.
2. Các Chi cục thuộc Sở Nông nghiệp và Môi trường:
a) Chi cục Trồng trọt và Bảo vệ thực vật;
b) Chi cục Chăn nuôi và Thú y;
c) Chi cục Thuỷ sản;
d) Chi cục Thuỷ lợi;
đ) Chi cục Chất lượng và Phát triển nông thôn.
3. Đơn vị sự nghiệp công lập thuộc Sở Nông nghiệp và Môi trường:
a) Văn phòng Đăng ký đất đai;
b) Trung tâm Phát triển quỹ đất;
c) Trung tâm Công nghệ thông tin;
d) Trung tâm Quan trắc tài nguyên và môi trường;
đ) Trung tâm Khuyến nông và Dịch vụ nông nghiệp;
e) Ban Quản lý Cảng cá Tiền Giang;
g) Ban Quản lý Rừng phòng hộ và Khu bảo tồn sinh thái Đồng Tháp Mười.